Diferencia entre shRNA y siRNA

shRNA vs siRNA

Durante el proceso de interferencia de ARN (ARNi), la expresión de un gen diana se reduce con alta especificidad y selectividad. El ARNi es un proceso natural e involucra pequeños ARN interferentes (ARNip) y un ARN de horquilla corta (ARNsh) y un ARNip bifuncional. Actualmente, el ARNi se usa ampliamente como una herramienta para la terapia personalizada contra el cáncer. Las aplicaciones de ARNi se realizan básicamente con las moléculas de ARNip de doble cadena y ARNsi sintetizadas químicamente. Aunque estas dos moléculas tienen resultados funcionales similares, difieren en su estructura; por lo tanto, los mecanismos moleculares de acción, las rutas de ARN y los efectos fuera del objetivo de estas dos moléculas también difieren.

shRNA

El shRNA es una secuencia de una pequeña molécula de ARN que da un giro cerrado que puede usarse para silenciar la expresión de un gen diana durante el ARNi. La expresión de shRNA se logra mediante un vector, que puede ser un virus o una bacteria o mediante la administración de plásmidos. Se sintetizan en el núcleo de las células y se transportan al citoplasma para procesos adicionales. Estas moléculas tienen vías de maduración similares de miRNA; por lo tanto, la síntesis de miRNA ha proporcionado las bases para la comprensión de la síntesis de shRNA. La RNA polimerasa II o III puede transcribir shRNA a través de los promotores de RNA polimerasa II o III. La ventaja del uso de los ARNsh es que tienen una tasa relativamente baja de degradación y rotación. La desventaja es que necesita un vector de expresión, que puede causar algunos problemas de seguridad.

siRNA

Los ARNip son moléculas de ARN de doble cadena compuestas por 20 a 25 pares de bases de longitud. Estos se utilizan para la supresión de genes mediante el silenciamiento de cualquier gen con una secuencia de nucleótidos complementaria en la ruta de RNAi. La desactivación de genes por transfección de ARNip a menudo no tiene éxito debido al efecto transitorio; Especialmente en las células en rápida división y la supresión no duran más. Para superar este problema, el ARNsi se modifica mediante la introducción de una estructura de horquilla corta. Esta molécula modificada entonces conocida como shRNA. shRNA debe convertirse en siRNA por un Dicer para continuar su función normal.

¿Cuál es la diferencia entre shRNA y siRNA?

• A diferencia del siRNA, el shRNA tiene una estructura extra de horquilla. shRNA es una versión modificada de siRNA.

• shRNA requiere un vector de expresión, mientras que siRNA no.

• El shRNA se puede usar para la eliminación a largo plazo, mientras que el siRNA se puede usar solo para la eliminación a corto plazo de los genes.

• A diferencia de la supresión de genes de siRNA, la supresión de shRNA es de larga duración, y si se inserta a través de un vector viral apropiado, puede producir efectos silenciadores de genes permanentes.

• Se requiere que Dicer convierta el shRNA nuevamente a la molécula siRNA para ejecutar sus funciones normales.